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九五至尊老品牌学院动态 生物学院林金星教授团队在功能基因组研究取得新进展
生物学院林金星教授团队在功能基因组研究取得新进展
来源:生物学院高琼    编辑:杨丽娜    发表时间:2013-05-15     浏览次数:


    木材形成是一个复杂的生物学过程。维管形成层是木本植物侧向分生组织,由它分裂产生的次生维管组织使得树木不断增粗。与模式植物拟南芥和水稻相比,林木具有休眠和周期性生长的特点,基因组资源非常丰富。然而,林木许多优良基因尚未被分离利用, 大部分基因的功能仍处于未知状态。因此深入研究林木维管形成层的发育模式和调控机制,具有重要的理论意义。

    九五至尊老品牌生物学院林金星教授研究团队应用弦向冰冻切片技术,将不同时期的维管形成层细胞取出,然后通过高通量Solexa测序技术,结合荧光实时定量PCR技术及生物信息学技术,对杉木次生生长过程中控制木材形成相关的特异表达基因进行系统研究和鉴定。研究发现:转录组文库测序得到59,669条Unigene,其中16,517条Unigene参与了119个已知的代谢或信号通路。与Nr数据库、Swiss-Prot 数据库、GO分类和COG数据库比对,分别对34,749、23,887、12,365和18,713个转录本进行了注释或分类。通过数字基因表达谱(DGE)分析和差异表达基因的检测,共筛选到5,298个差异表达基因,并发现在活跃期形成层中差异表达基因数目呈现明显增加的趋势。通过与转录组文库比对分析,还获得了一批与形成层细胞的活性,细胞分裂、细胞增大、激素代谢和信号传导、转录调节、细胞壁和木质素生物合成相关的重要基因,为培育速生、优质、抗性强的林木良种储备了基因资源。

    上述研究结果已于5月2日在线发表在植物学领域国际学术期刊New Phytologist(DOI: 10.1111/nph.12301)。林金星教授团队的邱宗波为该论文的第一编辑,万迎朗、王延伟为合作编辑。该研究得到科技部973项目和教育部重大项目的资助。

论文链接http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.12301/pdf




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